Jagiellońskie Centrum Innowacji oferuje szeroki zakres usług w dziedzinie analizy proteomicznej opierając się na metodach elektroforetycznych, chromatograficznych i spektrometrii mas. Wykonujemy analizy metodą spektrometryczną aparatem Impact II QTOF (Bruker), z możliwością sprzężenia z chromatografem UHPLC (Dionex). Daje to możliwość rozdzielenia skomplikowanych mieszanin związków i wygenerowanie wysokorozdzielczych widm masowych z dokładnością pomiaru masy do 5 ppm (HRMS). Wykorzystanie techniki elektrorozpraszania pozwala na łagodną jonizację badanych cząsteczek (ESI), natomiast fragmentacja w komorze kolizyjnej na identyfikację nieznanych związków.
W zakresie analizy techniką spektrometrii mas Laboratorium oferuje:
- Wyznaczanie masy molekularnej białka/peptydu,
- Identyfikację białek i peptydów na podstawie popularnych baz danych (UniProt, NCBI),
- Identyfikację i lokalizację modyfikacji potranslacyjnych (PTMs),
- Analizę ilościową białek w oparciu o strategię bezznacznikową (Label-free).
Uzupełnieniem powyższej oferty proteomicznej jest charakterystyka białek metodami elektroforetycznymi, immunoenzymatycznymi i fizykochemicznymi. Bogata oferta technik pozwala na rozdzielenie białek w złożonych mieszaninach, identyfikację w oparciu o ich masę cząsteczkową, charakterystykę fizykochemiczną oraz oznaczenie wybranego białka. Laboratorium oferuje także usługę oczyszczenia białek z wykorzystaniem chromatografii niskociśnieniowej.
Oferujemy usługę izolacji i analizy białek ze złożonych mieszanin (np. mleko, płyny ustrojowe). Prowadzimy także prace badawczo-rozwojowe z zakresu analizy biochemicznej białek:
- Elektroforeza żelowa (SDS-PAGE, Native-PAGE) – Mini-PROTEAN Tetra Cell (Bio Rad)
- Western Blot – Mini Trans-Blot® Cell (Bio Rad)
- Wielokątowe rozpraszanie światła laserowego (MALS) sprzężone z systemem chromatograficznym – detektor DAWN8+ (WYATT) – analiza masy cząsteczkowej białka
- Spektroskopia UV-VIS – Evolution 201 (Thermo Scientific)
- Termoforeza mikroskalowa (MST) – Monolith NT.115 (Nanotemper) – analiza oddziaływań białek
- Powierzchniowy rezonans plazmonów (SPR) – Biacore X-100 (GE Healthcare) – analiza kinetyki wiązania kompleksów białkowych
- Test immunoenzymatyczny (ELISA) – jakościowe/ilościowe oznaczenie białka przy pomocy metody immunoenzymatycznej. Oznaczamy również obecność innych antygenów w próbkach biologicznych
Laboratorium posiada doświadczenie w prowadzeniu badań badawczo-rozwojowych w zakresie analizy białek będących lekami biologicznymi w fazie badań klinicznych. Nasz zespół przygotowuje wyniki pod kątem publikacji naukowych. Ponadto, oferujemy merytoryczne i praktyczne wsparcie startupów w badaniach proteomicznych.